Aktualnie zbiory Biblioteki PWT liczą ogółem 198,5 tysięcy jednostek. Księgozbiór historyczny stanowią głównie dwa zbiory: biblioteki przedwojennego Konwiktu Teologicznego we Wrocławiu oraz przedwojennej Biblioteki Wydziału Teologii Katolickiej Uniwersytetu Wrocławskiego. Dużą część księgozbioru stanowią też przedwojenne książki, przekazane przez księży-repatriantów. Zdecydowana większość to jednak zbiory współczesne, w tym także multimedialne.
Według stanu na dzień 31 grudnia 2021 roku księgozbiór wynosił:
Biblioteka zapewnia również swoim czytelnikom dostęp do książek elektronicznych na platformie IBUK Libra oraz do licencjonowanych krajowych i zagranicznych baz danych, w tym do bazy Atla Religion Database with AtlaSerials PLUS.